شارك مع مجموعة من الشباب الحسيني في انتفاضة صفر 1397 ه/ 1977 م المتوجهة إلى كربلاء مشياً على الأقدام، رغم الإجراءات الأمنية المشدّدة، والتي حاصرتهم بالطائرات والدبابات والمدرعات والآليات العسكرية لمنعهم من المسير إلى كربلاء لزيارة الأربعين.

وقد كان الشهيد السيّد مصطفى الهاشمي متأثّراً جدّاً بأفكار ونظريات السيّد الشهيد محمّد باقر الصدر قدس سره ومن المواظبين على زيارته وحضور مجالسه لا سيما في ليالي الخميس والجمعة، يغتنم أدنى فرصة لزيارته والتحدّث معه عن قرب، والإمام الشهيد الصدر بدوره كان يتوسّم فيه خيراً ويحبّه كثيراً ويأنس به. كما كان الشهيد السيّد مصطفى من المعجبين بشخصية الإمام الخميني، وبعد نجاح الثورة الإسلامية بقيادة الإمام الخميني ازداد حبّاً وتعلّقاً واندفاعاً نحو تأييد الثورة بكل الوسائل المتاحة لديه، من خلال توزيع النشرات وصور الإمام، وأشرطة صوتية من خطب وبيانات الإمام الخميني.

وبمناسبة إعلان البيعة والولاء للإمام الشهيد الصدر كان الشهيد السيد مصطفى من ضمن وفود البيعة، وعندما خرج من بيت الشهيد الصدر اعتقلته أجهزة الأمن في النجف ونقلته إلى مديرية الأمن العامة في بغداد، فلاقى أشد أنواع التعذيب من جلاوزة الأمن، لكنه ظلّ صامداً صلباً كالطود الشامخ لا تنال‌